Бұл мақала Юань империясы құлағаннан кейінгі кезеңдегі моңғолдардың тарихына арналған. Юань империясы жүйелік дағдарыстың, эпидемияның және кіші мұз дәуірінің басталуының салдарынан құлдырады. 1368 жылы моңғолдар солтүстік Қытайдан қуылды. Юньнань мен Ляодундағы жекелеген моңғоланклавтары 70-80 жылдарға дейін созылды. XIV ғ. Тогон-Темі рқазірдің өзінде Солтүстік Юань әулетін құрды. XIV ғасырдың басына дейін Моңғол даласында шыңғысидтер басым болды. 1438 жылы Шығыс Моңғол қарсыласы Аругтайды жеңді. Есеннің өзін Хаган деп жариялау әрекеті Шығыс моңғолдардыңда, ойраттардың да қарсылығына тап болды. 1455 жылы Есеннің қайтыс болуы Дурбен Ойрат конфедерациясының ықпалының төмендеуіне әкелді. XV ғасыр Моңғолиядағы ең қатал дағдарыс кезеңі болды. БірнешежылбойыХаганмүлдемболғанжоқ. 80-шіжылдары XV ғ. Мандулай-ХатунныңкөмегіменДаянханбиліккекеледі. ОлШығысмоңғолдардыбіріктіреді. ТайшиИбурай, МандулайжәнеБурхайоғанқарсытұрды. Даянхандаланыбіріктіріп, қарсыластарынқуыпжібердіКукунор, Минимпериясынашабуылжасап, үлкенжетістіктергежеттіэсенгеқарағанда. ДаянханБодиАлагқайтысболғаннанкейінМоңғолияалтыхошунконфедерациясынаайналады. БұлконфедерацияныАлтанханменТуменДзасактуханбасқарды. 1592 жылыТумен-ЗасактуқайтысболғаннанкейінЧахархандығымоңғолдарарасындаБуянсец-ханныңбасшылығынанайырылды. КөшбасшылықтыЧахархандығынақайтарудыЛигденханқайтарды. Олманьчжурлардыңкеңеюінетапболдыжәнеоны 1634 жылғадейінұстады.Оңтүстікмоңғолдар 1636 жылыЦинимпериясыныңқұрамынакірді. Лигденхансметасынанкейінмоңғоләлеміндегікөшбасшылықтыхотогойталтанхандарыменойратжоңғархунтайджибөлісті. Бұл бәсекелестік ойраттардың пайдасына шешілді 1667 жлубсан-Тайшаны жеңген. Халха моңғолдары сетсенхандарының, тушетухандарының және дзасактухандарының иеліктеріне бөлінді. 80-жылдары XVII ж. ойратх унтайджихалха-моңғолдарды қысып, соңғыларын Долоннор құрылтайындағы маньчжурлық жүздікті мойындауға мәжбүр етті. 20-30 жылдары XVIII ғ. маньчжурлар өздерінің вассалдарының құқықтарын едәуіршектеді. 1758-1759 жылдары Халха-Моңғолияда көтеріліс көтерілді Чингунжаб, бірақ оны маньчжурлар басып тастады. 1760 жылдан кейін Халха-Моңғолия Айсинь Джиоро әулетіне тығыз тәуелді болды. ХХ ғасырдың басында моңғолдар тәуелсіздік үшін күресті бастады, ол 1911 жылы сәттілік пен аяқталды.